近代中医教育の発展は大体三段階に分けられる。
第一段階：晩清時代。清同治元年（1862年）に京師に同文館が設立され、太医院教習廳に医学館が再設された。光緒末年には各地に中医団体組織が出現し、官営医学教育の継続と民間中医教育の興隆期である。
第二段階：北洋政府時代。民国2年（1913年）に神州医药总会が北京に赴き、中医・中薬の提唱を請願し、別に中医薬専門学校を設立することを承認された。1925年、全国教育聯合会は教育部に中医課程を明定し、医学教育规程に列入する案を決議した。これが我国中医界が学校設立申請を成功させた開始期である。
第三段階：民国時代。1929年から1949年まで、我国中医界は困難な道のりの中で学校教育を堅持し、学校教育を発展させ、教育自立の道を切り開いた。これは中医近代史の輝かしい篇章の一つである。
近代中医教育には、伝統的な師弟教育も含まれており、中医院校教育と並行し、補完しながら発展し、近代中医教育史上一定の位置を占めている。
光緒24年（1898年）に医学堂が設立され、大学堂に所属した。変法失敗により、すべての「新政」が撤回されたが、唯一京師大学堂だけが保存された。その後、光緒28年（1902年）春に張百熙が『欽定京師大学堂章程』を起草し、大学の専門分科科目に医術が第七に列挙され、医学と薬学の二目に分かれた。
京師大学堂は医学専門教育の需要に応じ、1903年に医学館の設立を計画した。
光緒33年（1907年）に京師医学館を京師医学専門学堂に改称し、中西学科を併修し、それぞれ深造し、実用に役立つことを宗旨とした。どのような補習普通科目を設けるか、年限をどのように定めるかは、学部が選ばれた員を派遣して詳議することとした。しかし、当時、我が国における中医教育または西医教育のいずれも経験が不足しており、学部は各科目の教育規程を具体的に定めることができず、京師医学専門学堂の学生全員を日本に留学させることになった。朝廷の官営中医教育はこれで一旦停止した。
我国近代史上、民間で最初に出現した中医教育機関は浙江省瑞安県の利濟医学堂である。利濟医学堂は清光緒11年（1885年）に創立され、主催者は陳虬（字志三、号蟄廬、楽清出身）である。1885年、同志を集めて浙江温州府瑞安城東に院舎を建設し、学堂を人材育成の場としたいと考えた（林乾良：『我国近代早期の中医学校』、『中华远史杂志』、1980、10(2)：90）。
1912年、医学求益社は医学衛生社に改名し、宗旨がより明確になった。「医界団体の連携、医務教育の振興」である（『广州医学求益社卷』、广州十七甫怀驿关东雅面印本、1914）。1917年、この社から「广东中医教員养成所」が誕生し、1918年、元の求益社の同人らが「广东医学实习馆」を設立した。1924年までに、すべてが広東光漢中医専門学校に統合された。これにより、近代の中医院校は実際には中医药団体組織から生まれ、また、中医药団体組織が自団体の集団的利益を守るために、自らの教育事業を創設・発展させ、その利益に貢献できる専門人材を育成する必要があった。
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