현대 의학은 침술의 주요 작용이 인체 기능을 조절하고, 면역계 기능을 강화하여 인체의 저항력을 높이는 것이라고 본다. 또한 침술은 항염, 진통, 해열, 쇼크 예방, 마비 예방 등의 효과도 있다.
세계보건기구(WHO)는 특정 지역 회의에서 임시로 다음과 같은 질병에 대해 침술 치료가 가능하다고 정했다. 이 질병 목록은 임상 경험을 기반으로 하며, 임상 대조 연구를 기반으로 한 것은 아니다. 또한, 이 목록에 포함된 일부 질병에 대한 침술 치료의 효과는 아직 확립되지 않았다.
상부 호흡기 질환: 급성 부비동염, 급성 비염, 일반 감기, 급성 편도염.
호흡기 질환: 급성 기관지염, 천식(어린이 및 합병증이 없는 환자에게 효과적).
안과 질환: 급성 결막염, 중추성 망막염, 어린이 근시, 합병증이 없는 백내장.
구강 질환: 치아 통증, 잇몸 뽑은 후 통증, 잇몸염, 급·만성 인후염.
위장관계 질환: 식도 및 문괄근 경련, 메스꺼움, 위하수, 급·만성 위염, 위산 분비 과다, 만성 12지장궤양(통증 완화), 급성 12지장궤양(합병증 없음), 급·만성 대장염, 급성 세균성 이질, 변비, 설사, 마비성 장폐쇄.
신경/근육 질환: 두통 및 편두통, 삼차신경통, 안면마비(초기, 3~6개월 이내), 뇌졸중 후 마비, 말초신경염, 소아마비 후유증(초기, 6개월 이내), 메니에르병, 신경성 방광기능 장애, 야간소변, 갈비간신경통, 어깨목 증후군, 냉결절(어깨주위염), 테니스 elbow, 좌골신경통, 하부 요통, 관절염.
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