一、針灸療法的起源
針灸起源有人以為早於藥物，這一結論可能是一種主觀的想像推斷，很難有確切的依據。針或灸的醫療方法，都需要借助醫療工具，且需刺灸人身的一定部位，應該說較難於藥物知識的累積。針刺工具之發展，大體上有這樣一個過程，即砭石→箴石→箴→（钅咸）→針。如此，則其質之發展改進似由砭石而石針、竹針木刺、骨針、青銅針、鐵針、金銀針……等。砭石在遠古不單用於刺病，而且用於外科化膿性感染的切開放膿的可能性更大些。晉代郭璞注《山海經·東山經》之砥石時說：「可以為砥針，治癰腫者。」清代郝懿行認為「砥當為砭字之誤，可以為砭針是也」。《說文解字》注：「砭，以石刺病也。」可見，砭石在遠古的用處，一是治化膿性感染的膿腫；一是以石刺病，可能包括有針刺穴位的針灸療法在內。
現代學者大多認為砭石為針之母體，那麼針灸起源于砭石應該是有道理的。這不但從文獻記載找出了不少依據，在發掘的原始社會、新石器遺址中也有不少砭石存在，我國考古發掘，原始社會的砭石、石針、骨針、青銅針等越來越多，許多形狀也大體相似，給討論針灸的起源增添了珍貴的資料。至於傳統的觀點，如《路史》「伏義……而制九針」。明顯地，制九針晚於制針，更晚於砭石之打制和應用，如果伏義制九針的故事有其一定的真實性，那麼伏義時代約相當原始社會的山顶洞人時期，砭石之用於外科、針灸當至少已有萬年以上的历史。
針灸療法除針刺療法外，還有灸療法，灸的起源也很有趣，不過從文獻記載和考古發掘中均未能得到較確切的證據，因而人們的研究只能出於一種推論。譬如：人們認為現代用艾絨做成艾炷或艾條，點燃以烘烤或燒灼熏人體一定之穴位，用以治療某種疾病，既用火、艾火治病，為考其最早起源，便想到了原始人用火、人工取火的方法，將燒熱的卵石熨身以驅寒，並把熱卵石熨身某一部位對某種不適更有效的經驗不斷累積，療法即從中慢慢誕生。這種推論雖然未必完全符合歷史實際，但不無一定的科學道理。《素問·異法方宜論》在論述灸法的來源時有這樣一段話，即：「北方者，……真地高陵居，風寒冰冽，其野處而乳食。藏寒生滿病，其治宜灸焫。故灸焫者，亦從北方來。」兩千多年前醫學家之這一認識其根據不得而知，至少是人們和醫家口耳相傳的歷史傳說之類的記事作依據。灸法始於原始人取火用火領域不斷擴大之際，恐怕不會有很大的偏差。
二、外治法和按摩導引的起源
原始社會人們的生活、生產水平低下，條件極差。為了生存，人與野獸的搏鬥，氏族部落之間的爭奪搏鬥及惡劣環境所致，外傷、風濕性疾病、關節之風寒濕痹等，是原始社會人們的常見病。對此，和先民逐漸累積經驗，產生抵禦和預防的思想和措施。譬如：《呂氏春秋·古樂》在論述原始人歌舞時指出：「昔陶唐之始，陰多滯伏而湛積，水道壅塞，不行其原，民氣鬱阝而滯著，筋骨瑟縮不達，故作為舞以宣導之。」它真實地描述了遠古人們生活於陰暗、潮濕的環境裡，因此造成人們多患筋骨瑟縮不達的風寒濕痹之關節疾病。人們創用舞蹈運動，預防這些常見病。按摩、導引既用於解除人們因過度的體力勞動所引起的肌肉僵硬、關節勞損，也用於防治因與野獸搏鬥或戰爭搏鬥所引起的傷害和骨關節折傷脫臼，人們由最初之盲目、不自覺到自覺認識，按摩、導引、外治法即逐漸從中而誕生。
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